Desain, perencanaan dan pembangunan Masjid Al-Birru Pertiwi dilakukan oleh PT. Garis Prada di bawah pimpinan Bapak Uke Setiawan, seorang arsitek yang telah banyak memiliki pengalaman membangun masjid ternama seperti Masjid Kubah Emas di Depok, Jawa Barat yang sangat indah. Bapak Uke Setiwan merencanakan dan membangun Masjid Al-Birru Pertiwi tanpa memungut biaya apapun dan menjadikannya sebagai bentuk partisipasi dan wakaf beliau. Bertindak sebagai Pimpinan Proyek Masjid Al-Birru Pertiwi adalah Bapak Edy Hendriyanto yang juga suami dari putri bungsu Bapak/Ibu Santosa Hardjosuwito/Pertiwi.

Secara fisik, bangunan utama masjid Al-Birru Pertiwi berukuran sekitar 25 m (panjang) x  13 m (lebar) yang memiliki tiga lantai, yaitu lantai dasar yang digunakan untuk ruang pertemuan, lantai satu untuk jama’ah pria serta lantai dua untuk jama’ah wanita.  Di sekitar masjid, sedang dalam proses pembangunan, adalah ruangan untuk pendidikan, pelatihan dan perpustakaan.